Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mrpl4Q9DCU6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl4Q9DCU6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl4Q9DCU6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl4Q9DCU6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl4Q9DCU6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl4Q9DCU6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl4Q9DCU6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl4Q9DCU6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl4Q9DCU6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl4Q9DCU6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl4Q9DCU6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl4Q9DCU6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl4Q9DCU6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl4Q9DCU6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mrpl4Q9DCU6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mrpl4Q9DCU6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mrpl4Q9DCU6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mrpl4Q9DCU6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mrpl4Q9DCU6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mrpl4Q9DCU6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mrpl4Q9DCU6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mrpl4Q9DCU6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mrpl4Q9DCU6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mrpl4Q9DCU6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mrpl4Q9DCU6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mrpl4Q9DCU6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mrpl4Q9DCU6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mrpl4Q9DCU6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mrpl4Q9DCU6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mrpl4Q9DCU6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Mrpl4Q9DCU6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mrpl4Q9DCU6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mrpl4Q9DCU6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mrpl4Q9DCU6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mrpl4Q9DCU6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mrpl4Q9DCU6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mrpl4Q9DCU6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mrpl4Q9DCU6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mrpl4Q9DCU6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mrpl4Q9DCU6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mrpl4Q9DCU6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mrpl4Q9DCU6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mrpl4Q9DCU6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mrpl4Q9DCU6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mrpl4Q9DCU6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mrpl4Q9DCU6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms