Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms