Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pop7Q9DCH2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pop7Q9DCH2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pop7Q9DCH2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pop7Q9DCH2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pop7Q9DCH2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pop7Q9DCH2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pop7Q9DCH2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pop7Q9DCH2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pop7Q9DCH2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pop7Q9DCH2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pop7Q9DCH2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pop7Q9DCH2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pop7Q9DCH2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pop7Q9DCH2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pop7Q9DCH2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pop7Q9DCH2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pop7Q9DCH2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pop7Q9DCH2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pop7Q9DCH2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pop7Q9DCH2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pop7Q9DCH2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pop7Q9DCH2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pop7Q9DCH2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pop7Q9DCH2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pop7Q9DCH2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pop7Q9DCH2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pop7Q9DCH2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pop7Q9DCH2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pop7Q9DCH2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pop7Q9DCH2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pop7Q9DCH2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms