Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cyp27a1Q9DBG1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms