Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Ftsj3Q9DBE9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ftsj3Q9DBE9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ftsj3Q9DBE9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms