Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW9

Cnn3, Calponin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3Q9DAW9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnn3Q9DAW9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn3Q9DAW9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn3Q9DAW9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn3Q9DAW9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn3Q9DAW9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn3Q9DAW9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn3Q9DAW9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn3Q9DAW9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn3Q9DAW9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn3Q9DAW9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn3Q9DAW9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn3Q9DAW9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn3Q9DAW9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn3Q9DAW9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn3Q9DAW9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn3Q9DAW9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn3Q9DAW9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn3Q9DAW9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn3Q9DAW9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn3Q9DAW9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnn3Q9DAW9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnn3Q9DAW9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnn3Q9DAW9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnn3Q9DAW9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnn3Q9DAW9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnn3Q9DAW9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnn3Q9DAW9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnn3Q9DAW9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnn3Q9DAW9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn3Q9DAW9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn3Q9DAW9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn3Q9DAW9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn3Q9DAW9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn3Q9DAW9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn3Q9DAW9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn3Q9DAW9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn3Q9DAW9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn3Q9DAW9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn3Q9DAW9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn3Q9DAW9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn3Q9DAW9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn3Q9DAW9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn3Q9DAW9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn3Q9DAW9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn3Q9DAW9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnn3Q9DAW9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnn3Q9DAW9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnn3Q9DAW9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnn3Q9DAW9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms