Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAH1

Scp2d1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scp2d1Q9DAH1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scp2d1Q9DAH1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scp2d1Q9DAH1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms