Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA83

1700018B08Rik, RIKEN cDNA 1700018B08, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018B08RikQ9DA83 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
1700018B08RikQ9DA83 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700018B08RikQ9DA83 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
1700018B08RikQ9DA83 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
1700018B08RikQ9DA83 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700018B08RikQ9DA83 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700018B08RikQ9DA83 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700018B08RikQ9DA83 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700018B08RikQ9DA83 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700018B08RikQ9DA83 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700018B08RikQ9DA83 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700018B08RikQ9DA83 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700018B08RikQ9DA83 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700018B08RikQ9DA83 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700018B08RikQ9DA83 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700018B08RikQ9DA83 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700018B08RikQ9DA83 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700018B08RikQ9DA83 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700018B08RikQ9DA83 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700018B08RikQ9DA83 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700018B08RikQ9DA83 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
1700018B08RikQ9DA83 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms