Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9DA42 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9DA42 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9DA42 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9DA42 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9DA42 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9DA42 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9DA42 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9DA42 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9DA42 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9DA42 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q9DA42 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q9DA42 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q9DA42 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q9DA42 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q9DA42 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q9DA42 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Q9DA42 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q9DA42 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q9DA42 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q9DA42 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q9DA42 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q9DA42 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q9DA42 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q9DA42 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Q9DA42 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q9DA42 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q9DA42 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Q9DA42 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9DA42 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9DA42 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9DA42 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9DA42 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9DA42 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9DA42 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9DA42 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9DA42 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9DA42 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9DA42 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9DA42 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9DA42 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9DA42 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9DA42 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9DA42 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9DA42 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9DA42 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9DA42 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9DA42 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9DA42 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9DA42 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9DA42 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9DA42 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9DA42 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9DA42 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9DA42 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9DA42 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9DA42 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9DA42 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9DA42 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9DA42 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q9DA42 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q9DA42 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q9DA42 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q9DA42 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q9DA42 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q9DA42 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q9DA42 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q9DA42 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q9DA42 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q9DA42 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q9DA42 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Q9DA42 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q9DA42 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q9DA42 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q9DA42 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q9DA42 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q9DA42 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q9DA42 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q9DA42 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q9DA42 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q9DA42 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q9DA42 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q9DA42 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q9DA42 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q9DA42 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q9DA42 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q9DA42 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q9DA42 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q9DA42 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q9DA42 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q9DA42 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Q9DA42 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q9DA42 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q9DA42 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q9DA42 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q9DA42 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q9DA42 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q9DA42 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q9DA42 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q9DA42 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms