Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smco2Q9DA21 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Smco2Q9DA21 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms