Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA19

Cir1, Corepressor interacting with RBPJ 1, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cir1Q9DA19 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cir1Q9DA19 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cir1Q9DA19 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cir1Q9DA19 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cir1Q9DA19 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cir1Q9DA19 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cir1Q9DA19 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cir1Q9DA19 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cir1Q9DA19 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cir1Q9DA19 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cir1Q9DA19 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cir1Q9DA19 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cir1Q9DA19 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cir1Q9DA19 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cir1Q9DA19 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cir1Q9DA19 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cir1Q9DA19 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cir1Q9DA19 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cir1Q9DA19 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cir1Q9DA19 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cir1Q9DA19 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cir1Q9DA19 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cir1Q9DA19 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cir1Q9DA19 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cir1Q9DA19 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms