Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdzd9Q9D9M4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
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