Protein–RNA interactions for Protein: Q9D968

Hcfc2, Host cell factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc2Q9D968 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hcfc2Q9D968 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hcfc2Q9D968 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hcfc2Q9D968 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hcfc2Q9D968 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hcfc2Q9D968 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hcfc2Q9D968 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hcfc2Q9D968 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hcfc2Q9D968 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hcfc2Q9D968 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hcfc2Q9D968 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms