Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms