Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slx4ipQ9D7Y9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slx4ipQ9D7Y9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slx4ipQ9D7Y9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms