Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnfsf13Q9D777 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfsf13Q9D777 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms