Protein–RNA interactions for Protein: Q9D742

Ap5s1, AP-5 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5s1Q9D742 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap5s1Q9D742 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap5s1Q9D742 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap5s1Q9D742 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap5s1Q9D742 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap5s1Q9D742 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap5s1Q9D742 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ap5s1Q9D742 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ap5s1Q9D742 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ap5s1Q9D742 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ap5s1Q9D742 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap5s1Q9D742 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms