Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gbe1Q9D6Y9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gbe1Q9D6Y9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gbe1Q9D6Y9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gbe1Q9D6Y9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gbe1Q9D6Y9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gbe1Q9D6Y9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gbe1Q9D6Y9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbe1Q9D6Y9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbe1Q9D6Y9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbe1Q9D6Y9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbe1Q9D6Y9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbe1Q9D6Y9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbe1Q9D6Y9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbe1Q9D6Y9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbe1Q9D6Y9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbe1Q9D6Y9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbe1Q9D6Y9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbe1Q9D6Y9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gbe1Q9D6Y9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gbe1Q9D6Y9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gbe1Q9D6Y9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Gbe1Q9D6Y9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gbe1Q9D6Y9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gbe1Q9D6Y9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gbe1Q9D6Y9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gbe1Q9D6Y9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gbe1Q9D6Y9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gbe1Q9D6Y9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gbe1Q9D6Y9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gbe1Q9D6Y9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gbe1Q9D6Y9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gbe1Q9D6Y9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gbe1Q9D6Y9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gbe1Q9D6Y9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gbe1Q9D6Y9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gbe1Q9D6Y9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gbe1Q9D6Y9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gbe1Q9D6Y9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gbe1Q9D6Y9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gbe1Q9D6Y9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gbe1Q9D6Y9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms