Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6X5

Slc52a3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a3Q9D6X5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Slc52a3Q9D6X5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc52a3Q9D6X5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc52a3Q9D6X5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc52a3Q9D6X5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc52a3Q9D6X5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc52a3Q9D6X5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc52a3Q9D6X5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc52a3Q9D6X5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc52a3Q9D6X5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc52a3Q9D6X5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc52a3Q9D6X5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Slc52a3Q9D6X5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc52a3Q9D6X5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc52a3Q9D6X5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc52a3Q9D6X5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc52a3Q9D6X5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc52a3Q9D6X5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc52a3Q9D6X5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc52a3Q9D6X5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc52a3Q9D6X5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc52a3Q9D6X5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc52a3Q9D6X5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc52a3Q9D6X5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc52a3Q9D6X5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc52a3Q9D6X5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc52a3Q9D6X5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Slc52a3Q9D6X5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Slc52a3Q9D6X5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms