Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
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Rab11fip1Q9D620 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab11fip1Q9D620 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab11fip1Q9D620 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab11fip1Q9D620 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab11fip1Q9D620 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab11fip1Q9D620 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab11fip1Q9D620 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab11fip1Q9D620 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab11fip1Q9D620 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab11fip1Q9D620 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab11fip1Q9D620 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab11fip1Q9D620 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab11fip1Q9D620 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab11fip1Q9D620 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab11fip1Q9D620 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab11fip1Q9D620 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab11fip1Q9D620 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab11fip1Q9D620 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab11fip1Q9D620 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab11fip1Q9D620 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab11fip1Q9D620 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab11fip1Q9D620 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab11fip1Q9D620 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab11fip1Q9D620 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab11fip1Q9D620 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab11fip1Q9D620 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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Rab11fip1Q9D620 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab11fip1Q9D620 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab11fip1Q9D620 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab11fip1Q9D620 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab11fip1Q9D620 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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Rab11fip1Q9D620 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab11fip1Q9D620 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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Rab11fip1Q9D620 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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Rab11fip1Q9D620 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab11fip1Q9D620 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab11fip1Q9D620 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab11fip1Q9D620 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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Rab11fip1Q9D620 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
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Rab11fip1Q9D620 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
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Rab11fip1Q9D620 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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Rab11fip1Q9D620 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab11fip1Q9D620 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab11fip1Q9D620 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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Rab11fip1Q9D620 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab11fip1Q9D620 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab11fip1Q9D620 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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Rab11fip1Q9D620 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab11fip1Q9D620 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab11fip1Q9D620 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab11fip1Q9D620 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab11fip1Q9D620 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rab11fip1Q9D620 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rab11fip1Q9D620 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rab11fip1Q9D620 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rab11fip1Q9D620 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab11fip1Q9D620 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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