Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc39Q9D5Y1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc39Q9D5Y1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc39Q9D5Y1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms