Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PudpQ9D5U5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms