Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D4W2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D4W2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D4W2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D4W2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D4W2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D4W2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D4W2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms