Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2al3Q9D4U4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al3Q9D4U4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms