Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ribc2Q9D4Q1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ribc2Q9D4Q1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms