Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J9

4931423N10Rik, MCG52616, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931423N10RikQ9D4J9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4931423N10RikQ9D4J9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms