Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H8

Cul2, Cullin-2, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul2Q9D4H8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cul2Q9D4H8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul2Q9D4H8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms