Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lonrf3Q9D4H7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms