Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Clvs1Q9D4C9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms