Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C5

Eaf1, ELL-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eaf1Q9D4C5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Eaf1Q9D4C5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eaf1Q9D4C5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eaf1Q9D4C5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eaf1Q9D4C5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eaf1Q9D4C5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eaf1Q9D4C5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Eaf1Q9D4C5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms