Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rsph14Q9D3W1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rsph14Q9D3W1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rsph14Q9D3W1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms