Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3G5

Stx11, Syntaxin-11, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx11Q9D3G5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx11Q9D3G5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx11Q9D3G5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx11Q9D3G5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx11Q9D3G5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx11Q9D3G5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx11Q9D3G5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx11Q9D3G5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx11Q9D3G5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx11Q9D3G5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx11Q9D3G5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx11Q9D3G5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx11Q9D3G5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx11Q9D3G5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx11Q9D3G5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx11Q9D3G5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx11Q9D3G5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx11Q9D3G5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx11Q9D3G5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx11Q9D3G5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx11Q9D3G5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx11Q9D3G5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx11Q9D3G5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx11Q9D3G5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx11Q9D3G5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Stx11Q9D3G5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms