Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fndc8Q9D2H8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Fndc8Q9D2H8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc8Q9D2H8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc8Q9D2H8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc8Q9D2H8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Fndc8Q9D2H8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc8Q9D2H8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc8Q9D2H8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fndc8Q9D2H8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc8Q9D2H8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc8Q9D2H8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc8Q9D2H8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc8Q9D2H8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc8Q9D2H8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc8Q9D2H8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Fndc8Q9D2H8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Fndc8Q9D2H8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Fndc8Q9D2H8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc8Q9D2H8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fndc8Q9D2H8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Fndc8Q9D2H8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc8Q9D2H8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc8Q9D2H8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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Fndc8Q9D2H8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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Fndc8Q9D2H8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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Fndc8Q9D2H8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc8Q9D2H8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fndc8Q9D2H8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc8Q9D2H8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fndc8Q9D2H8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Fndc8Q9D2H8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Fndc8Q9D2H8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc8Q9D2H8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc8Q9D2H8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc8Q9D2H8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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Fndc8Q9D2H8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc8Q9D2H8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc8Q9D2H8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc8Q9D2H8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc8Q9D2H8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc8Q9D2H8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc8Q9D2H8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fndc8Q9D2H8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc8Q9D2H8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc8Q9D2H8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc8Q9D2H8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc8Q9D2H8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc8Q9D2H8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc8Q9D2H8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc8Q9D2H8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc8Q9D2H8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc8Q9D2H8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc8Q9D2H8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc8Q9D2H8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc8Q9D2H8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc8Q9D2H8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc8Q9D2H8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fndc8Q9D2H8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
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