Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc6bQ9D289 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc6bQ9D289 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms