Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Y9

Shisal2b, Protein shisa-like-2B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2bQ9D1Y9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shisal2bQ9D1Y9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Shisal2bQ9D1Y9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisal2bQ9D1Y9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisal2bQ9D1Y9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Shisal2bQ9D1Y9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisal2bQ9D1Y9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisal2bQ9D1Y9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Shisal2bQ9D1Y9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisal2bQ9D1Y9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisal2bQ9D1Y9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisal2bQ9D1Y9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Shisal2bQ9D1Y9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Shisal2bQ9D1Y9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisal2bQ9D1Y9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisal2bQ9D1Y9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisal2bQ9D1Y9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisal2bQ9D1Y9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisal2bQ9D1Y9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisal2bQ9D1Y9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisal2bQ9D1Y9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisal2bQ9D1Y9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Shisal2bQ9D1Y9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Shisal2bQ9D1Y9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisal2bQ9D1Y9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Shisal2bQ9D1Y9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisal2bQ9D1Y9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Shisal2bQ9D1Y9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Shisal2bQ9D1Y9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisal2bQ9D1Y9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisal2bQ9D1Y9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisal2bQ9D1Y9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisal2bQ9D1Y9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Shisal2bQ9D1Y9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisal2bQ9D1Y9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisal2bQ9D1Y9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisal2bQ9D1Y9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisal2bQ9D1Y9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisal2bQ9D1Y9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Shisal2bQ9D1Y9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisal2bQ9D1Y9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisal2bQ9D1Y9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisal2bQ9D1Y9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisal2bQ9D1Y9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shisal2bQ9D1Y9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms