Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms