Protein–RNA interactions for Protein: Q9D174

Ss18l2, SS18-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l2Q9D174 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ss18l2Q9D174 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ss18l2Q9D174 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ss18l2Q9D174 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ss18l2Q9D174 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ss18l2Q9D174 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ss18l2Q9D174 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ss18l2Q9D174 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ss18l2Q9D174 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ss18l2Q9D174 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ss18l2Q9D174 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ss18l2Q9D174 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ss18l2Q9D174 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ss18l2Q9D174 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ss18l2Q9D174 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ss18l2Q9D174 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ss18l2Q9D174 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ss18l2Q9D174 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ss18l2Q9D174 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ss18l2Q9D174 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ss18l2Q9D174 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ss18l2Q9D174 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Ss18l2Q9D174 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Ss18l2Q9D174 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ss18l2Q9D174 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ss18l2Q9D174 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Ss18l2Q9D174 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ss18l2Q9D174 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ss18l2Q9D174 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ss18l2Q9D174 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Ss18l2Q9D174 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Ss18l2Q9D174 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ss18l2Q9D174 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ss18l2Q9D174 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ss18l2Q9D174 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ss18l2Q9D174 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ss18l2Q9D174 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Ss18l2Q9D174 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ss18l2Q9D174 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ss18l2Q9D174 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ss18l2Q9D174 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ss18l2Q9D174 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ss18l2Q9D174 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ss18l2Q9D174 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Ss18l2Q9D174 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ss18l2Q9D174 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ss18l2Q9D174 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ss18l2Q9D174 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ss18l2Q9D174 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms