Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pbdc1Q9D0B6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pbdc1Q9D0B6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pbdc1Q9D0B6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pbdc1Q9D0B6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pbdc1Q9D0B6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pbdc1Q9D0B6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pbdc1Q9D0B6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pbdc1Q9D0B6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pbdc1Q9D0B6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pbdc1Q9D0B6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pbdc1Q9D0B6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pbdc1Q9D0B6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pbdc1Q9D0B6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pbdc1Q9D0B6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pbdc1Q9D0B6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pbdc1Q9D0B6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pbdc1Q9D0B6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pbdc1Q9D0B6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pbdc1Q9D0B6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pbdc1Q9D0B6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pbdc1Q9D0B6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pbdc1Q9D0B6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pbdc1Q9D0B6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pbdc1Q9D0B6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pbdc1Q9D0B6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pbdc1Q9D0B6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pbdc1Q9D0B6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pbdc1Q9D0B6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pbdc1Q9D0B6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pbdc1Q9D0B6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pbdc1Q9D0B6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pbdc1Q9D0B6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pbdc1Q9D0B6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pbdc1Q9D0B6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pbdc1Q9D0B6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pbdc1Q9D0B6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pbdc1Q9D0B6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pbdc1Q9D0B6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pbdc1Q9D0B6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pbdc1Q9D0B6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pbdc1Q9D0B6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pbdc1Q9D0B6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pbdc1Q9D0B6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pbdc1Q9D0B6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pbdc1Q9D0B6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pbdc1Q9D0B6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pbdc1Q9D0B6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pbdc1Q9D0B6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pbdc1Q9D0B6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms