Protein–RNA interactions for Protein: Q9D083

Spc24, Kinetochore protein Spc24, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spc24Q9D083 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spc24Q9D083 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spc24Q9D083 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spc24Q9D083 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spc24Q9D083 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Spc24Q9D083 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spc24Q9D083 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spc24Q9D083 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spc24Q9D083 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spc24Q9D083 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spc24Q9D083 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spc24Q9D083 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spc24Q9D083 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spc24Q9D083 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spc24Q9D083 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Spc24Q9D083 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms