Protein–RNA interactions for Protein: Q9D032

Ssbp3, Single-stranded DNA-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp3Q9D032 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssbp3Q9D032 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ssbp3Q9D032 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms