Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZU9

2610524H06Rik, RIKEN cDNA 2610524H06, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610524H06RikQ9CZU9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
2610524H06RikQ9CZU9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
2610524H06RikQ9CZU9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms