Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT6

Cmss1, Protein CMSS1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmss1Q9CZT6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cmss1Q9CZT6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cmss1Q9CZT6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms