Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Thumpd2Q9CZB3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Thumpd2Q9CZB3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Thumpd2Q9CZB3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Thumpd2Q9CZB3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Thumpd2Q9CZB3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Thumpd2Q9CZB3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Thumpd2Q9CZB3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Thumpd2Q9CZB3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Thumpd2Q9CZB3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Thumpd2Q9CZB3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Thumpd2Q9CZB3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Thumpd2Q9CZB3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Thumpd2Q9CZB3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Thumpd2Q9CZB3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Thumpd2Q9CZB3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Thumpd2Q9CZB3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Thumpd2Q9CZB3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Thumpd2Q9CZB3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Thumpd2Q9CZB3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Thumpd2Q9CZB3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Thumpd2Q9CZB3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Thumpd2Q9CZB3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Thumpd2Q9CZB3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Thumpd2Q9CZB3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Thumpd2Q9CZB3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Thumpd2Q9CZB3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Thumpd2Q9CZB3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Thumpd2Q9CZB3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Thumpd2Q9CZB3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Thumpd2Q9CZB3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Thumpd2Q9CZB3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Thumpd2Q9CZB3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Thumpd2Q9CZB3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Thumpd2Q9CZB3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Thumpd2Q9CZB3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Thumpd2Q9CZB3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Thumpd2Q9CZB3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Thumpd2Q9CZB3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms