Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ssu72Q9CY97 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms