Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX00

Ist1, IST1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ist1Q9CX00 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ist1Q9CX00 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ist1Q9CX00 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ist1Q9CX00 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ist1Q9CX00 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ist1Q9CX00 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ist1Q9CX00 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ist1Q9CX00 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ist1Q9CX00 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ist1Q9CX00 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ist1Q9CX00 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ist1Q9CX00 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ist1Q9CX00 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ist1Q9CX00 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ist1Q9CX00 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ist1Q9CX00 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ist1Q9CX00 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ist1Q9CX00 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ist1Q9CX00 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ist1Q9CX00 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ist1Q9CX00 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ist1Q9CX00 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ist1Q9CX00 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ist1Q9CX00 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ist1Q9CX00 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ist1Q9CX00 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ist1Q9CX00 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ist1Q9CX00 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ist1Q9CX00 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ist1Q9CX00 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ist1Q9CX00 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ist1Q9CX00 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ist1Q9CX00 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ist1Q9CX00 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ist1Q9CX00 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ist1Q9CX00 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ist1Q9CX00 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ist1Q9CX00 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ist1Q9CX00 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ist1Q9CX00 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ist1Q9CX00 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ist1Q9CX00 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ist1Q9CX00 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ist1Q9CX00 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ist1Q9CX00 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ist1Q9CX00 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ist1Q9CX00 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ist1Q9CX00 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ist1Q9CX00 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ist1Q9CX00 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ist1Q9CX00 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ist1Q9CX00 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ist1Q9CX00 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ist1Q9CX00 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ist1Q9CX00 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ist1Q9CX00 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ist1Q9CX00 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ist1Q9CX00 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ist1Q9CX00 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ist1Q9CX00 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ist1Q9CX00 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ist1Q9CX00 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ist1Q9CX00 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ist1Q9CX00 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ist1Q9CX00 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ist1Q9CX00 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ist1Q9CX00 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ist1Q9CX00 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ist1Q9CX00 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ist1Q9CX00 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ist1Q9CX00 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ist1Q9CX00 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ist1Q9CX00 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ist1Q9CX00 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ist1Q9CX00 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ist1Q9CX00 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ist1Q9CX00 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ist1Q9CX00 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ist1Q9CX00 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ist1Q9CX00 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ist1Q9CX00 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ist1Q9CX00 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ist1Q9CX00 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ist1Q9CX00 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ist1Q9CX00 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ist1Q9CX00 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ist1Q9CX00 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ist1Q9CX00 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ist1Q9CX00 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ist1Q9CX00 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ist1Q9CX00 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ist1Q9CX00 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ist1Q9CX00 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ist1Q9CX00 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ist1Q9CX00 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ist1Q9CX00 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ist1Q9CX00 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ist1Q9CX00 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ist1Q9CX00 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ist1Q9CX00 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms