Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

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Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tdrd12Q9CWU0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Tdrd12Q9CWU0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Tdrd12Q9CWU0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Tdrd12Q9CWU0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tdrd12Q9CWU0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tdrd12Q9CWU0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tdrd12Q9CWU0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tdrd12Q9CWU0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Tdrd12Q9CWU0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tdrd12Q9CWU0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tdrd12Q9CWU0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Tdrd12Q9CWU0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Tdrd12Q9CWU0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tdrd12Q9CWU0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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Tdrd12Q9CWU0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tdrd12Q9CWU0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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Tdrd12Q9CWU0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Tdrd12Q9CWU0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tdrd12Q9CWU0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Tdrd12Q9CWU0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tdrd12Q9CWU0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tdrd12Q9CWU0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Tdrd12Q9CWU0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tdrd12Q9CWU0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tdrd12Q9CWU0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tdrd12Q9CWU0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Tdrd12Q9CWU0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tdrd12Q9CWU0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tdrd12Q9CWU0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tdrd12Q9CWU0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tdrd12Q9CWU0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tdrd12Q9CWU0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tdrd12Q9CWU0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tdrd12Q9CWU0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tdrd12Q9CWU0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tdrd12Q9CWU0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tdrd12Q9CWU0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tdrd12Q9CWU0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tdrd12Q9CWU0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tdrd12Q9CWU0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms