Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
4930535I16RikQ9CUI2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930535I16RikQ9CUI2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms