Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sft2d3Q9CSV6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sft2d3Q9CSV6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms