Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rprd1bQ9CSU0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rprd1bQ9CSU0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rprd1bQ9CSU0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms