Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snw1Q9CSN1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Snw1Q9CSN1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Snw1Q9CSN1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Snw1Q9CSN1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Snw1Q9CSN1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snw1Q9CSN1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snw1Q9CSN1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snw1Q9CSN1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snw1Q9CSN1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snw1Q9CSN1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Snw1Q9CSN1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snw1Q9CSN1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snw1Q9CSN1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snw1Q9CSN1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snw1Q9CSN1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snw1Q9CSN1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snw1Q9CSN1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snw1Q9CSN1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snw1Q9CSN1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snw1Q9CSN1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snw1Q9CSN1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snw1Q9CSN1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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